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天昊生物微生物多样性测序云平台全面升级!


上海天昊生物 

为了进一步满足广大客户的需求,让微生物多样性分析内容更加多元化,经过多轮调试,天昊生物微生物多样性测序分析云平台GS-Online全面升级!

升级后的GS-Online云平台具有以下优势:
  • 功能强大:常规相对定量扩增子测序和16S扩增子绝对定量测序均支持线上分析;

  • 操作简单操作界面极其简单,快速得到完整报告,一键即可下载;

  • 自主性强:根据您的科研需求,自由分组,自由删减OTU或物种;

 


 
接下来让我们一起看看升级后的GS-Online云平台如何使用吧。

01

  数据准备

拿到项目分析结果后,云平台分析所需数据均在Total_OTU目录下,打开Total_OTU目录:(1)绝对定量测序项目目录下有OTU文件、单位DNA/样本的OTU文件、分组文件、环境因子数据和功能预测数据;(2)相对定量测序项目目录下有OTU文件、分组文件、环境因子数据和功能预测数据。

图片
 

绝对定量文件结构


图片

 

相对定量文件结构


图片
 

 
02

  云平台使用

登录云平台


 
打开天昊生物官网,点击技术支持,点击云平台即可登录,或输入:http://cloud.geneskybiotech.com/login.html 登录,输入用户名和密码登录。账号申请请联系销售经理。

 
新建分析
登录后,点击新建项目,输入项目名称,点击项目名称,新建分析。

 
提交数据
  • 绝对定量数据提交

输入分析名后,依次导入所需数据,点击运行;
其中功能预测的数据,如仅分析COG,则只提交COG的文件就可以。

 
  • 相对定量数据提交


 
数据结果查看
点击分析名称,可以看到分析进展。如果没有报错信息,一般30分钟~4小时分析完成。


 

结果展示
点击项目名称,点击新建的分析后,弹出如下链接,单击链接即可下载结果。

 
链接打开后,如下图所示,可以查看结题报告。右上角有下载链接。分析结果请及时下载至本地电脑。


 

 

 

03

  文件格式

OTU文件
打开OTU数据,如下图所示:A列是OTUid名称,中间是样品中OTU丰度,后面是OTUid的注释。
 
 
分组文件
打开分组文件,如下图所示:文件需要有表头,A列是样品名,后面是不同的分组信息。以B列为例,36个样品分为4组一起分析,最终的结果在ABCD目录下存放。

 
功能预测文件
功能预测的文件,COG文件需要以COG_id:description为表头。KEGG文件需要以KEGG_id:description为表头。如下所示:

 
环境因子数据
环境因子数据A列是样品名称,后面是环境因子的数据。名称不能有中文、空格。环境因子数据中若有空单元格,则这一行样品的数据剔除不分析。



 

 

 

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